面臨澎湖馬糞海膽近年來嚴重的生態浩劫，雖然保育團體認為馬糞海膽的銳減，與人為濫捕有關，但漁民認為今年初寒害、澎湖縣種苗繁殖場未放流種苗等，都有可能是海膽族群銳減的原因。
不過種苗場這2年研發馬糞海膽養殖技術有成，發現成體海膽不挑食，100隻2天就可以把一顆高麗菜吃光光。
澎湖縣種苗繁殖場長柯志鴻表示，今年6月初繁殖了一批小海膽，已經成功的沈底，並附著在池壁、漁網、板子上面，種苗場已經成功將野外抓到的海膽，順利培育成為「種膽」，並撫育成功產出二代的馬糞海膽，目前已有養殖戶躍躍欲試，積極參與養殖計畫。
澎湖馬糞海膽因為鮮味足、甘甜度高，備受各地饕客喜愛，不過原名為「白棘三列海膽」的馬糞海膽為雌雄異體，撥開黑色硬殼後映入眼前的黃色腺體即為海膽的生殖腺（卵巢及精囊），也是最主要食用的部位，海膽性腺發育成熟期約落在每年5月至9月。
△民眾出海3小時採捕。
△每年馬糞海膽開放日，就是大屠殺日。
△每年馬糞海膽開放日，就是大屠殺日。