車船處表示，為減少資源浪費，本項增開的學生專船航班除維持設籍望安、七美學生收取保險費外，必須依照使用者付費原則收費，懇請鄉親們都能體諒並支持。但為兼顧離島居民福利，車船處將會給予設籍望安、七美居民搭乘馬公-望安票價為140元或馬公-七美票價為200元的優惠，一般乘客則仍依車船處公告票價表收費。
同時為顧及學生搭船返鄉權益，本學生專船去程馬公→望安→七美將不受理電話預約訂票，係採現場排隊購票，於15：50-16：45由設籍望安、七美學生優先購票，每人每次最多限購4張，若仍有空位再於開航前5分鐘開放一般民眾購票搭乘；回程七美→望安→馬公則歡迎於開航前一日以電話06-9272376預約。
車船處本項增開航班，為每週五16：50開航馬公→望安→七美，18：30開航七美→望安→馬公，基於安全性考量，若因風浪過大或如有因颱風或天氣等不可抗力因素致航班停駛者，本處將不另行通知，請自行上本處網站(http://www.phpto.gov.tw)查看，有關航班如有異動將隨時公告於候船室及車船處網站最新消息，倘造成民眾之不便，敬請見諒。