車船處表示，實施本項航班，係貫徹縣府照顧離島居民、便利望安、七美二鄉離島居民交通往返及公務洽公之便，增加搭乘選擇性。為兼顧離島居民福利，車船處將會給予設籍望安、七美居民搭乘馬公-望安或馬公-七美票價為200元的優惠，一般乘客則仍依車船處公告票價表收費，懇請鄉親們都能體諒並支持。
為方便乘客事先規劃行程，夜泊七美航班將自開船日前1個月受理電話預約訂票，受理對象為一般民眾、每人每次最多限購4張，預約名額60名（額滿為止，不再增開加班船），訂票時間為每日11:00~19:00。訂票專線(06)9272376、傳真9270335。完成電話預約訂票者，須於開船前1〜2日上午11:00〜19:00至本處公車總站付款並取票。如因旅客個人因素致取消行程者，得於開航前1日21:00以前來電06-9272376申請退票，手續費為船票票價10％。
車船處夜泊七美航班，為固定每週一、三16：50開航馬公→望安→七美，翌日週二、四06：00七美→望安→馬公，各往返一航次，有關航班如有異動將隨時公告於候船室及車船處網站最新消息。