澎湖縣長賴峰偉20日在防疫會議中指示在機場、港口成立居家檢疫報到站，凡從大陸港澳入境持有居家檢疫通知書者，轉搭國內線、臺華輪入境澎湖，縣府將協請航空公司、臺華輪向旅客廣播，必須至報到站登記，不配合者將依傳染病防治法處3,000元至1萬5,000元罰鍰。
依現行居家檢疫規定，居家檢疫者入境後必須儘速返回住處，留在家14天，不得外出。但縣府民政處實際查訪發現，往往民眾回到澎湖2、3天後，縣府才收到內政部民政司提供的居家檢疫名單，無法掌握民眾是否確實在家，形成防疫隱憂。
澎湖縣政府臺北辦公室主任陳其育表示，有大陸港澳旅遊史者，入境國際機場均須填寫「新冠肺炎」入境健康聲明書暨居家檢疫通知書。全國每天約有3,000份居家檢疫通知書，中央單位光是鍵打資料、查核就要用掉約2天，再發送到全國各縣市，大多會延遲2、3天，各縣市都面臨防疫空窗期的難題。
陳其育建議，澎湖為海島相較本島縣市，較易掌握入境民眾動線，建議在機場、港口設立「居家檢疫報到站」，並協調航空公司、台華輪，在入境澎湖前向旅客廣播，凡持有居家檢疫通知書者，都必須至「居家檢疫報到站」登記，核對居住地、電話，並立即通知里長、村里幹事啟動健康關懷，居家檢疫者返家後，限制外出至檢疫解除。
賴峰偉指示，民政處立即在機場、港口設置「居家檢疫報到站」，並由旅遊處向航空公司、台華輪協調代為廣播，並要求衛生局針對拒絕、規避者，以傳染病防治法第36條、70條處新臺幣3,000以上1萬5,000元以下罰鍰。
賴峰偉要求社會處以「新住民查核系統」每日追蹤尚未返澎的69位陸配及家屬動向，並責成旅遊處向各旅行社查詢近期出國民眾名單，先期掌握返國時間，加強追蹤，務必做到滴水不漏。