三總澎湖分院自105年通過教學醫院評鑑、醫院評鑑合格，是全國少數離島教學醫院。「畢業後一般醫學訓練」緣起於民國92年SARS疫情衝擊，行政院衛生署提出，重整臨床醫師養成訓練改革計畫，當年7月即正式公告「畢業後一般醫學訓練—因應SARS疫情醫師人力儲備計畫」。而先進國家醫學生在畢業後採一至二年的「一般醫學訓練」，讓畢業生獲得獨立行醫的能力，是世界各國醫學教育的趨勢。
畢業後一般醫學訓練的目的，主要以學習者為中心，將原本課堂上醫學知識臨床實務，能與社區醫療、保健能密切結合，充份瞭解醫病溝通、醫學倫理、人文及社會關懷，讓每位醫師能未來執業時，體會到「視病猶親」的真諦。
課程安排，除了靜態「預防醫學概念及應用」、「安寧緩合醫療照護」、「中老年族群之健康照護」等。室外教學，搭配「社區健康促進」、「社區健康診斷」、「社區健康資源整合(IDS)」等室外教學課程，每一堂課程都有別於學校教學，每位醫師都能透過社區衛教講解，親身體會與民眾的互動。
張芳維院長在結訓座談會時表示，三總澎湖分院除了擔任地區軍民醫療守護角色，更兼具教學醫院責任，每年協助來自北中南各地醫療機構，培訓畢業醫接受社區醫學訓練。醫院針對每位學員，精心規劃各種實務課程，讓學員能順利完成6個月中第一部分PGY訓練；大家有機會來到澎湖地區學習的特色，就是能親自體會到偏鄉離島的醫療困境，相信對於每位醫師養成訓練，將是難忘的學習經驗，也鼓勵每位學員，未來都能發揮史懷哲的大愛無私精神，為每位患者提供最佳醫療服務。
△三總澎湖分院PGY醫師課程結訓。
△座談會。