印花稅屬憑證稅，是由納稅人自行貼花、銷花完成納稅，因憑證種類繁多，立據人易誤貼或漏貼，因此每年均實施印花稅檢查，以遏止逃漏，維護租稅公平。稅務局呼籲納稅人自行檢視應稅憑證，如有漏貼或貼繳不足者，請儘速依稅捐稽徵法第48條之1規定自動補報補繳並加計利息，以免受罰，如經查獲短、漏繳印花稅者，除補繳所漏稅額外，另按所漏稅額處5至15倍之罰鍰，請納稅人注意相關規定，莫因一時疏忽致荷包損失。
納稅人如因憑證甚多不便貼用印花稅票者，可向本局申請按期彙總繳納，也可透過地方稅網路申報作業網站(網址 https://net.tax.nat.gov.tw)申請印花稅大額憑證總繳帳號，經核准後即可至該網站開立印花稅繳款書繳納，取代貼用印花稅票，省時又便利，歡迎多加利用。