不過，昨選舉前縣議會議事人員仍將秘密投票的圈選處拿出，遭到政壇老將陳海山質疑，既以改為記名投票，已經沒有秘密可言，卻又以秘密投票的形式讓議員投票，並要求撤除圈選處，隨即獲議員張再興、宋國進附和。
同時，陳海山要求議事人員應先說明投票規定，否則新規上路稍有不慎，選票將變廢票，且相關規範不明，若圈選後亮票又是否違法，最後他痛批中央此舉是對議員的不信任、甚至是侮辱，且可以適用議會，未來全國大小選舉是否應比照。
不過經議事人員說明溝通後投票仍繼續進行，議會秘書長廖英賢則強調會蒐集議員意見向中央反映。
投票人是否唱名 議會與代表會不同調
而澎湖首度記名投票規範不明確，議會與各地代表會也都出現不同調，昨議會選舉唱票時逐張唱名投票人與圈選得票人，但以白沙鄉代表會模式，則是記名後，僅唱名得票人。至於逐張唱名投票人方式是否違法，地方法院院長李淑惠則表示還要再研究，當選結果也要由相關機關來做最後確認。
