澎湖是觀光名勝地區，近年觀光人次已破百萬，許多不法份子利用旅遊旺季，從台灣本島挾帶毒品到澎湖販售牟利。澎湖是塊美麗淨土，光復不允許毒品進入澎湖毒害鄉親健康，於是在去(106)年4月編組成立警犬隊，透過緝毒犬敏銳嗅覺反應，協助警方執行安檢工作及查緝不法之毒品，成為打擊犯罪、建構無毒家園好助手。
澎湖警犬隊為全國4支警犬隊中第3支成立的縣市，成立之初透過各種管道尋覓適當幼犬供訓練使用，迄今已有德國狼犬2隻、比利時狼犬1隻、米格魯4隻、邊境牧羊犬1隻、拉不拉多2隻，共10隻幼犬。領犬員並跨海前往保三總隊取經受訓長達1個月，籌備多時，終於在106年4月15日正式成立。
警犬隊成立一年多以來，屢次建功，破獲攜毒乘客，確實發揮查緝嚇阻功能，杜絕毒品流入。106年在馬公機場查獲毒品闖關案，第三級毒品K他命49.3克，及多處民宅販賣毒品，查扣第二級毒品安非他命76.5公克，成效斐然。
澎湖是世界最美麗海灣城市，光復不容許毒品危害青年幼苗與社會，透過緝毒犬強化緝毒新能量，將毒品阻絕於境外，防制毒品氾濫，讓學生遠離毒品危害，光復有責任為社會治安、家庭幸福，建立無毒家園環境，讓青年學子幸福快樂成長。