該分局進一步就所得稅、營業稅、貨物稅、菸酒稅等稅目之減免規定說明如下：
一、所得稅：受災戶應於災害發生後30日內，檢具損失清單及證明文件，報請所在地國稅局分局或稽徵所派員勘查，經核定後，得於辦理該年度綜合所得稅或營利事業所得稅結算申報時，列報災害損失；如災區內之工廠或分支機構與總公司分屬不同縣市者，亦可向工廠或分支機構所在地國稅局分局或稽徵所就近申請派員勘查。
二、營業稅：小規模營業人因災害影響無法營業者，可向管轄國稅局分局或稽徵所申請，准予扣除其未營業之天數，以實際營業天數計徵營業稅。
三、菸酒稅：受災之菸酒稅產製廠商或菸酒進口商，其已稅或免稅菸酒消滅或受損致不能出售者，於災害發生後30日內，檢具損失清單及相關證明文件向管轄國稅局報備，申請已納菸酒稅及菸品健康福利捐之退還或銷案。
四、貨物稅：受災之貨物稅廠商，其已稅或免稅貨物消滅或受損致不能出售者，於災害發生後30日內，檢具損失清單及相關證明文件向管轄國稅局報備，申請已納稅款之退還或銷案。
該分局強調，對於民眾之災害損失，將秉持從寬、從速原則，主動協助及輔導受災納稅義務人申請（報）各項稅捐減免，有關災害損失申請書表可至南區國稅局網站（https://ntbsa.gov.tw）「災損報備專區」下載使用，或可利用財政部稅務入口網（https://www.etax.nat.gov.tw）線上申報（請）災害損失稅捐減免，快速又省時。納稅義務人如對於災害損失稅捐減免有不盡明瞭的地方，可於上班時間撥打免費服務專線0800-000-321，將有專人為您服務。