澎湖縣政府表示，演習當日下午1時30分至2時實施交通管制及人車疏散避難，各機場、港口的飛機、船舶均正常起降、行駛、靠離，下機（船）旅客及接送親友車輛（人員），仍需實施防空疏散避難，欲前往搭機（船）者，應提早出發，以免延誤報到時間。
澎湖縣政府呼籲民眾，萬安46號演習主要目的在驗證防空整備與作為，策進防空機制運作與效能，以降低空襲損害，確保人民生命財產安全，請鄉親務必配合。
同時也特別提醒轄內的超市、商場，演習警報發放後，除需關閉門窗外，也要記得將燈光熄滅；路上行人、車輛駕駛及乘客，應聽從警察及民防執勤人員引導，或運用手機「警政服務APP-防空疏散避難專區」導航進入附近有黃色「防空避難設備」標誌牌處所。
各旅行社（業者）、飯店等，應勸導觀光客於演習期間，能遵行各項防空演習規定，並配合疏散避難的要求。