依據統計至7月1日，澎湖完成追加劑（第三劑）接種率為73.1%，疫苗完整接種率排名全國第二高，且高於全國平均完成追加劑接種率（70%）。
澎湖縣政府表示，近期全國及澎湖疫情均有緩降趨勢，在疫情最高峰期間，三總澎湖分院、部立澎湖醫院機動調度醫護人員、開設專責病房，惠民醫院、衛生所支援集中檢疫所，順利維持澎湖醫療量能正常運作。
澎湖縣政府表示，從5月上旬開始衛生局至各校為兒童施打疫苗，並透過全國獎勵額度最高的2,000元禮劵鼓勵75歲以上長者施打疫苗，達成澎湖疫苗完整接種率全國第二高的成績。
澎湖縣政府指出，澎湖在高疫苗接種率的保護，以及各醫療院所提供縝密的照護下，雖然面對嚴峻的疫情挑戰，仍將疫情控制在盛行率8.13%、染疫致死率0.09%均為全國第二低的狀況。
△全國各縣市本土COVID-19盛行率。