澎湖南方之東吉嶼、西吉嶼及東嶼坪與、西嶼坪嶼，在 19 世紀中葉開始有聚落成形，居民主要由泉州、金門等地移入望安，再二次遷徙至此地。
為鼓勵居民參與傳統建築保存維護，若屬傳統閩南式建築及具地方特色之華洋混合建築依原樣修繕者，可向海管處申請補助最高達新臺幣300萬元；若屬結合傳統建築語彙，並符合聚落整體風貌之新建、增建、改建或修建之建築，可申請補助最高達新臺幣150萬(以上申請人自籌款不得低於補助項目總工程費百分之五十)，降低居民修繕維護的資金壓力，目前已完成修復2棟傳統建築，屋主並善加運用活絡地方發展。
此外，東吉村113號許宅為島上著名的兩層式洋樓建築，乃東吉國小許振坤校長故居，其後人認同國家公園經營理念爰捐贈給海管處，海管處已委託專業團隊進行整修規劃，並邀請許家人出席表達意見與期望，完成後將提供展示教育及遊客服務功能，成為當地傳統建築活化利用的代表案例。
考量許多鄉親移居外地，無暇往返南方四島處理繁瑣的建築修繕工程，也難以長居島上維護管理屋舍。對於此類有管理困擾且建物所有權清楚者，海管處已開始受理申請交給政府全額負擔修復、活化利用與保養維護，於20年後再交還民眾，使民眾沒有經費及管理壓力，讓先祖遺留的古厝與家鄉記憶，有機會傳承給下一代。
澎湖南方四島傳統建築安靜地立於小島之濱，好似時光膠囊封存了海角印象，但建物終究難敵風化毀壞，海管處將持續與民眾合作推動保存活化，讓這個美好的風景留給更多人回味，並提升環境體驗品質與社區經濟發展。
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△東吉嶼的洋樓式傳統建築。
△東嶼坪依偎在山凹處的傳統合院建築。
△東嶼坪依偎在山凹處的傳統合院建築。