港務公司表示，自疫情警戒標準提升至第三級，各港港區清消作業均持續辦理，並於24日，針對轄管港區之辦公廳舍內公共區域、旅運場站、遊憩區、管制站、管制區內各單位建築物、倉庫、露置場、碼頭、在建工程等周圍，啟動全面性深度清消工作。如辦公廳舍內公共區域每2小時清消1次；旅運場站於旅客進入前立即執行清消，旅客候船室清消作業也從原本每2小時1次，提高頻率為每小時1次，當日旅客全數離開後，針對旅客經過及碰觸的場域與動線，透過擦拭及噴灑消毒液方式執行全面性的深度清消工作，杜絕病毒跨境傳染與蔓延，並以多媒體看板及海報等設備，加強國內線船舶旅客的防疫宣導。
除了前述執行徹底清消作業，港務公司也配合防疫措施，候船區域全面禁止飲食，內部啟動分區辦公、擴大彈性上下班及居家辦公等措施，以確保公務正常維持運作。
港區邊境管理的部分，則除了持續推動原有進出各國際商港港區通行證E化作業外，同時積極配合行政院政策使用「防疫實聯制簡訊登錄管理系統」，且外部人員進出港區門哨、辦公場所、裝卸場棧之辦公處所、在建工程工地、旅運場站等場所均配合辦理實聯制，落實防疫政策。
△商港全面執行深度清理消毒。