黑嘴端鳳頭燕鷗在記載上，從民國89年福建省馬祖列島發現紀錄以前，已經有超過60年以上未出現過，使其曾一度被認為已經絕種，故有「神話之鳥」之稱。因黑嘴端鳳頭燕鷗習性和鳳頭燕鷗相似，且混棲於鳳頭燕鷗群中繁殖。自民國95年起，在澎湖縣的雞善嶼，每年有2隻混在鳳頭燕鷗群中繁殖，105年還出現3對在雞善嶼繁殖。
「神話之鳥」黑嘴端鳳頭燕鷗，日昨澎湖縣鳥友張全坐船在雞善嶼巡航時，意外拍攝到黑嘴端鳳頭燕鷗。另澎湖縣野鳥學會調查研究組長鄭謙遜登雞善嶼島，亦在一群鳳頭燕鷗群中，發現了一隻黑嘴端鳳頭燕鷗的身影，並觀察了一段時間後，牠才飛離。
此鳥種，目前只發現於中國浙江省岩岸島嶼韭山列島、五峙山列島、福建省馬祖列鳥、台灣的澎湖群島和南韓的全羅南道的一個無人島繁殖，並在印尼與菲律賓過冬，為一瀕危物種。目前的監測數據顯示，該物種的全球種類總量大約100隻，在101年被世界自然保護聯盟列入全球最瀕危的100個物種。
△黑嘴端鳳頭燕鷗。（圖/澎湖縣政府農漁局委由鄭謙遜攝）