民航局表示，為儘早掌握旅客訂位情形及加速清艙作業，以利規劃後續加班機運能，旅客於訂票日起3日內應完成開票（例如5月22日訂票者，應於5月24日前完成開票），提醒旅客應注意開票期限，以確保自身權益。
為使空運資源作最有效之利用，避免因部分旅客重複訂位以致影響其他真正有需求民眾之權益，各航空公司仍將循往例於機票上加註「限當日當班次有效」及「逾期作廢」之使用限制。另於尖峰時段109年6月24日至26日臺灣出發往離島方向，以及109年6月27日至29日離島出發回臺灣方向之機票，均會加註「限當日當班次有效」及「逾期作廢」之使用限制，俾使有限之空運資源獲得更有效之利用。
第二波加班機開放訂位各航空公司受理訂位電話及網址：
立榮航空公司 (02)2508-6999 https://www.uniair.com.tw/rwd/index.aspx
華信航空公司 412-8008(手機加撥02) https://www.mandarin-airlines.com/