國中應屆畢業生，由就讀國中集體報名，免報名費。非應屆畢業生一律個別報名，非應屆畢業生請於3月9日上午8時至11日下午5時教育會考試務網站http://cap.ntnu.edu.tw完成網路報名，並於3月12日至14日上午8時至12時，下午1時30分至5時親自至馬公高中教務處報名及繳費，報名費為新台幣500元，低收入戶子女或其直系血親尊親屬支領失業給付者，檢附低收入戶證明及戶口名簿影本或公立就業服務機構核發之「就業保險失業（再）認定、失業給付申請書及給付收據」正本及戶口名簿影本，報名費則予以全免優待；中低收入戶子女檢附中低收入戶證明及戶口名簿影本，報名費減免60%（報名費新台幣200元）。
集體報名考生請洽就讀國中之報名單位；個別報名考生應繳資料：1、繳驗學歷證件及國民身分證（或戶口名簿）正本；2、上網(https://cap.nace.edu.tw/)網路報名，須上傳相片檔，報名後列印之個別報名表，且將國民身分證影本（正反面）貼在個別報名表指定位置上；3、報名費（持國外及大陸學歷認證之國民中學應屆畢業生免繳交報名費）；4、身心障礙及重大傷病考生應檢附相關合法有效證明文件正本、影本各1份，正本驗後發還；5、填妥收信人姓名、地址（同個別報名表通訊處），並各貼足新臺幣35元郵票之標準信封2個，以便寄發准考證及成績通知單。
109年國中教育會考考生及家長對國中教育會考相關訊息如需深入的了解，可以上109年全國試務會官網、國中教育會考官網等。