為鼓勵更多農地加入沼液沼渣作為農地肥分使用，或符合放流水標準水資源利用的行列，環保局設置諮詢專線(06-9219847)協助業者撰寫沼液沼渣肥分使用計畫書、農地施灌的媒合及計畫送審事宜等。為落實畜牧業循環經濟，鼓勵畜牧場及農民共襄盛舉，109年本局持續推動「畜牧糞尿資源化利用」，請有意願的畜牧場及農民可洽本局申請。
環保局指出，畜牧業者實施畜牧糞尿沼液沼渣農地肥分使用，不僅可省下廢水處理設施好氧曝氣之操作費用，且透過沼液沼渣施灌農地亦可減少每年繳納之水污染防治費，達到「資源化再利用」及「節能」的環保精神。同時為維護澎湖縣水環境，民眾若發現不法廢水排放等污染情事，請撥打全國免付費公害陳情專線0800-066-666或縣民服務專線1999檢舉，環保局將盡速前往處理，以維護水環境品質。