據了解，《國土計畫法》105年5月1日正式施行，被視為解決國土發展亂象的根本大法。依《國土法》，該法施行2年內公告實施「全國國土計畫」；全國國土計畫實施2年內（109年4月30日）公告實施「直轄市、縣（市）國土計畫」；縣市國土計畫實施2年內（111年4月30日）定出「國土功能分區」，全國土地的利用、規劃才算完成，管制也隨之正式上路，正式取代現行的《區域計畫法》。
建設處長表示，澎湖國土計畫依全縣土地資源特性、環境限制及未來發展需求，規畫「國土保育地區」、「海洋資源地區」、「農業發展地區」、「城鄉發展地區」等四大功能分區14項分類，帶動地方經濟發展，日前舉辦公展及7場次公聽會廣泛蒐集各方意見，預計明年5月公告實施後將作為澎湖最高空間指導計畫。
澎湖國土計畫總面積為86.89萬公頃，包括陸域面積及海域面積，其中陸域面積5.53萬公頃，包括「國土保育地區」4.34萬公頃、「農業發展地區」1萬公頃、「城鄉發展地區」1801公頃。海域面積全部屬於「海洋資源地區」，計81.36萬公頃，佔93%。
依規畫四大功能分區，在國土計畫指導下，基於適地適性、合法權益保障原則，將具有豐富資源、重要生態、珍貴景觀及易致災地區規畫為「國土保育地區」，確保國土安全，如6大水庫、玄武岩自然保留區、綠蠵龜產卵棲地保護區、保安林為主；海域範圍則畫設為「海洋資源地區」，如保育保護保留區域、海上平台、海底電纜、港區及6處軍事設施許可範圍等區域。
現有農地為維持良好農業生產環境，畫設「農業發展地區」，同時兼顧農業多元發展及農糧安全；既有發展地區及重大建設儲備用地則規畫為「城鄉發展地區」，採集約發展、成長管理，確保完整配套公共設施，並優先考量人口結構及發展趨勢，研擬發展或轉型策略，依規畫成果適度擴大既有鄉村區域。
針對有議員憂心新制度產生非都市土地使用分區、管制及變更開發方式的改變；洪處長指出，未來會有計畫的引導空間發展，讓該保育的地區落實保育，可發展的地區有效率發展，對於現有民眾土地使用權益基本上都會獲得保障。
議長劉陳昭玲表示，「縣市國土計畫」明年五月公告實施，澎湖將採用國土法規畫土地、海洋；他強調各項規劃措施，必須確保現有土地所有權人權利為前提，進而發揮土地最大價值，爭取土地所有權人的公平正義，並作出6點決議如下：
一、未來國土計畫全面實施後，現行區域計畫法與體系將廢止，雖然縣府已於今年9月委外擬定完成「澎湖縣國土計畫」（草案），並陸續辦理公開展覽及公聽會。唯鑒於此一變革影響層面甚廣，土地所有權人與利害關係人對於未來有知的權利，請縣府仍要廣為宣傳與進行了解基層意向，讓社會各界有所認知並納入「澎湖縣國土計畫」範疇，協助鄉親爭取保障既有權益。
二、依照國土計畫法第20條規定之各國土功能分區及其分類之劃設原則，無法如現行農變建制度得以個別變更作興建住宅所用，所以如何將本縣農變建制度之特殊性、合理性、相容性納入「澎湖縣國土計畫中」，或另訂本縣土地使用管制方式，以因應本縣地方實際需要，請縣府要有周延的規劃與配套措施，以利農變建制度能於「澎湖縣國土計畫」下續行，而來照顧本縣沒有自有住屋者居民之美意。
三、由於全國各縣市過去區域計畫法變更分區的情況太浮濫與寬鬆，皆以個案來考量，引發許多爭議。未來若要變更分區使用，必須透過國土計畫法規定長期5年或10年來通盤檢討修正，顯見農地變更成建地等方式將更臻嚴謹，請縣府事先要有因地制宜因應規劃，避免阻礙澎湖發展。
四、就國土計畫法的立法目的與內容而言，劃設時仍賦予地方有自主與彈性空間，請縣府規劃時可本諸下列3項原則與需求來規劃辦理：（1）可依施政差異、重大建設需要及重大產業投資劃設為城鄉發展地區。（2）國土功能分區部分，係由縣市政府主導規劃，中央訂定指導原則來審議，未來中央審議時請妥備相關資料爭取說明。（3）若地方情況特殊者，縣市政府可以因地制宜訂定土地使用管制規定，包含土地建蔽率、容積率、容許使用項目等。唯無論如何縣府規劃時也應力求審慎，避免衝擊居民生活與環境敏感地區，並兼顧地方真正需求與期待。
五、依現行國土計畫法下分區管理架構是以陸域管理思維為原則，不見得是完全能適用澎湖這種海洋縣市；尤其如依內政部營建署公布澎湖海域管轄範圍面積約7,936平方公里，約為澎湖縣陸域土地面積124平方公里的65倍情況下，在制定澎湖縣國土計劃分區時，如何兼顧海洋資源永續發展劃設時，請縣府不能忽視偏廢此一部分。
六、國土計畫法自111年5月正式上路後，原有的區域計畫法及相關子法都將廢止，取而代之的有國土計畫法施行細則、實施國土計畫所受損失補償辦法、重大公共設施或公用事業計畫認定標準等相關子法高達22種，目前內政部都陸續訂定，請縣府要全盤掌握了解，讓日後本縣亦能順暢適用。