配合海洋活化政策，縣府農漁局在漁業資源復育及棲地環境改善等部分，已先後完成沙蟹種苗大量放流、種苗投放優先選擇具自主管理意識社區、珊瑚礁種植棲地復育及多場海洋教育宣導活動等，現在更進一步與澎湖中心合作，以「海洋草原」為主題，帶領學童種植海草，讓海洋教育向下紮根，也深化在地社區自主管理海域棲地意識，未來結合種苗繁殖場投放適當水產種苗，讓漁業資源能生生不息。
本縣周邊近岸海域早期隨處可見海草床，不僅生物多樣性高，更像是澎湖海洋生物的資源庫，如同海洋生物的搖籃，孕育了許多生命。惟近年海洋棲地環境劣化，導致海草床生態系逐漸崩壞，使海草床大量流失，尤以內海最為明顯與嚴重。為解決此問題，行政院農業委員會水產試驗所澎湖海洋生物研究中心於103年開始在有如沙漠般的沙質地上進行海草復育，經4年的試驗後，海草已生長的相當濃密，海草床生態系儼然成形。
在海草床形成後，未來將結合種苗繁殖場進行放流投入資源，並委請澎湖中心進行海草移植與種苗放流效益評估，同時也將透過社區居民進行自主管理，有望成為臺灣海草床復育示範區，若能將此模式建立，未來更可推廣至本縣其他社區海域，逐年改善沿岸海域生態棲地，打造澎湖海洋活化的新契機。
