在水質分級方面，為兼顧水污染防治相關法令規定並以健康風險評估觀念導向，先以適用於游泳的甲類海域海洋環境品質標準中—大腸桿菌群落數為主要判定依據，符合標準者(即大腸桿菌群之菌落數1000 CFU/100mL以下)，再參考世界衛生組織及美國環保署之建議，以腸球菌群為娛樂用水水質分級，主要分為優良(大腸桿菌群≦1000 CFU/100mL，且腸球菌群≦50 MPN/100mL)、普通(大腸桿菌群≦1000 CFU/100mL，且腸球菌群 > 50 MPN/100mL)以及不宜親水活動(大腸桿菌群>1000 CFU/100mL)三種。相關監測結果公佈於海保署海洋保育資源網，民眾可前往該網站查詢，作為親水活動參考。(https://www.oac.gov.tw/GipOpen/wSite/mp?mp=oca)
環保局表示，颱風及暴雨過後海灘水質容易受到陸源污染物影響，遭受大量細菌等微生物污染，原因主要是大雨沖刷造成的垃圾及地面污水污染、糞便污染及下水道排水溢流污染等。因此，環保局呼籲民眾，颱風及暴雨過後水質較差，民眾若前往海灘不建議下水遊憩。另外，從事各項水上活動的同時，除需特別注意安全外，亦請隨手作環保，勿將垃圾丟入海中或棄置海邊，讓海域得以維持潔淨，民眾才能有乾淨美麗的海域遊憩。