鯨魚洞是小門嶼最特殊的海蝕地形，鯨魚洞東側現留有二支海蝕柱，是另一海蝕拱門頂部崩塌所形成的；原為一玄武岩的海崖，經過海蝕作用將玄武岩不斷的侵蝕，最後貫穿成一個海蝕門，是地理學上相當特別地形，因此鯨魚洞成為民眾來到澎湖必遊的景點之一。
除了鯨魚洞，小門嶼全島面積雖然只有0.5平方公里，但地質地形景觀，更是澎湖群島的縮影，堪稱戶外地質教室。可見到外形呈現球狀結構的多孔玄武岩，小門嶼層特殊的鐵質石英砂岩、鐵質黏土層、參雜動物化石的灰殼岩以及受流水侵蝕的小惡地形等多樣貌的地質景觀。
小門嶼還有蜂巢田式的菜宅、石敢當等人文特色景觀，以及可到「小門地質館」一窺澎湖的地質奧秘的好機會。
時常帶遊客前往小門鯨魚洞的導遊向本報反應，鯨魚洞的最西邊穀灰岩斷崖最近有明顯崩塌。
當地民眾表示，小門國小的西邊看殼灰岩層，己有掉落一段時間。主要於殼灰岩是由生物的介殼和其遺骸堆積而成，其中混雜有石英礫或粘土，雖然像咾咕石，卻沒有咾咕石的堅硬。但務必多注意安全切勿靠近岩壁，尤其勿恣意在岩壁下方步道處逗留，避免釀生意外。
△澎湖觀光景點小門鯨魚洞西側殼灰岩層有落石。（莊惠惠攝）