行政院農業委員會水產試驗所附屬水族館，經促參公司-「澎博海洋科技有限公司」(以下簡稱澎博公司) 於105年間依促參法第46條規定，以自提促參(OT+ROT)案方式向水試所主動提出水族館經營之申請，經評選後於106年6月23日與水試所簽約，旋即投入第一期的整建工作，於去 (107)年8月16日完成整建後營運。唯時逢澎湖當地觀光季節尾聲，未能打響名號、引領熱潮，經過數月的營運細節的優化調整。
澎博公司訂於(108)年4月4日上午9點-12點，特地邀請上級機關、澎湖相關業務往來單位、民意代表及社會各界，隆重舉辦盛大開幕活動，迎接即將來臨的澎湖觀光季，歡迎各界舊雨新知入館遊覽，體會澎湖美麗的海底世界。