全台各縣市中，中南部、東部、離島地區均有在台北設置辦公室前例，包括台中、花蓮、台東、高雄、台南、金門、馬祖等地。不過，諸如高雄、台中等辦公室設置後，也前後遭受質疑無績效、浮報加班、濫用公務車等爭議。
據了解，按縣府提出台北辦公室經費概算表，羅列水電費一年4萬元、通訊費每月6千元、租金每月5萬5千元、辦公設備一年20萬、業務費一年30萬，總計所需經費127萬2千元。
針對縣府擬設台北辦公室，行政處長洪棟霖說明，澎湖為離島縣市，與台灣本島交通聯繫較為不便，縣府為加強與中央接軌，強化與中央部會雙向聯繫與時效，以利爭取各項中央計畫之補助，並服務本縣旅台鄉親，及推動各項行銷澎湖觀光之工作需要，因此才規畫設置台北辦公室。
議員宋國進表示，縣府理由聽起來很充足，但澎湖長期沒有設置台北辦公室同樣可以爭取經費，究竟辦公室可以發揮多大公用，讓人不禁懷疑，打上一個大問號。
他說，依據縣府經費概算表，辦公處所將花費127萬，但裡頭卻看不見人員編制與費用，勢必未來還要編制人員預算。
洪處長則解釋，台北辦公室若獲議會支持，預估會編制2名員額，初期規劃由縣長簽派2名現職人員派駐該辦公室。
宋國進認為，不是其他縣市有設置，澎湖就非比照不可；台北辦公室最重要任務是跟中央協調溝通，派誰去「份量、層級」等應該都要納入考量，再說賴縣長前二任時，也不是國民黨執掌中央，當時都沒有要不到經費問題，難道現在就溝通不良，還是準備要派駐的人比較有能力，縣府這樣說法說不通，並質疑現在先派人上班，最後又增加人力，未來勢必成為黑機關。對於縣府成立台北辦公室，他個人堅持反對。
設置台北辦公室「沒必要」，陳慧玲指出，設置人員要適才適所，更重要的是要幫縣府跟中央單位協調溝通，顯然這個人必須非常專才，不僅對各單位業務都很專業、精通，還要能夠跟中央單位要錢。
但她曾聽聞，中央人士說澎湖所送過去的計畫都隨便亂寫，甚至有抄襲舊資料也不改，連送出去計畫被嫌爛，那又要叫這位專才怎麼跟中央溝通，與其花錢設置辦公室，不如提升縣府內部人員專業能力，最起碼讓顧問公司送進來的資料能夠仔細審查，只要計畫寫得好，後續首長去中央報告也落得輕鬆，再說這120餘萬租屋、辦公開支花費，直接拿來讓縣府人員住宿交通早已足夠。
會議最終，議長劉陳昭玲則要求行政處長先擬定設置要點提送大會，供議員做為審查依據。