澎湖海巡隊表示，大陸漁船越界捕魚除危害臺灣海域安全外，並嚴重破壞海底棲地及海洋資源，將持續結合鄰近機動海巡隊大型艦執行「護永專案」掃蕩專案勤務，加強取締越界陸船，日前扣留陸船經留置調查結果，依據臺灣地區與大陸地區人民關係條例第32條及80條之1規定，處以重罰，期能杜絕陸船越界侵入我國海域不當濫捕情事。
另，時逢大陸非洲豬瘟橫行，大陸漁船入港後海巡人員立即展開全面清艙，雖未發現任何豬肉製品，該隊仍持續與防檢疫機關密切配合，以防疫病境外移入。
統計去(107)年該隊執行強力取締工作，共扣留大陸漁船22艘，罰鍰金額共計新台幣1790萬元。
