本縣水質清澈無汙染，極適合發展大型海藻養殖，縣府農漁局所屬水產種苗繁殖場長期投入大型海藻量產研究，目前已確立長葉紫菜、海葡萄及長心卡帕藻等量產技術，並輔導漁民養殖中，另現階段亦投入青海菜(礁膜)、鋸齒麒麟菜及馬尾藻量產研究。
馬尾藻為海域中基礎生產者，可吸收水中營養鹽，形成海藻床吸引魚類聚集棲息，亦能提供海洋生物食物來源。因其富含碘、鉀、甘露醇和褐藻多醣，廣泛應用於醫藥及食品等工業，因馬尾藻相關養殖研究著墨不多，其相關報告主要是集中於其營養價值及生態環境之探討，在臺灣尚未有大規模人工養殖報導。
縣府水產種苗繁殖場已掌握馬尾藻有性生殖育苗技術，正開發種苗量產及海域復育技術，若能確立此技術，未來可望推廣養殖及進行人工藻床海域復育，使海藻資源維護及利用更具成效。
△馬尾藻人工育苗技術有望。