今年4月起，澎湖垃圾無法順利外運，湖西鄉垃圾轉運站累積3千餘噸垃圾，5月12日一度發生大火，事後李應元緊急來澎湖瞭解狀況。當時陳縣長特地召開記者會，宣稱2個月內可解決垃圾堆積問題，但4個月來，只清除291噸，垃圾堆置總量達4千噸。
賴峰偉指出，垃圾處理攸關民生及公共衛生，是非常重要的工作。然而，陳縣長5月15日開完記者會後，似乎就不再關心，否則4個月怎會只清291噸？顯然陳縣長認為開個記者會，就能交差了事，其心態與處理湖西中油油庫漏油如出一轍，以為發完慰問金，風波就能平息，得過且過，毫無地方父母官對鄉親應有的關懷。
他說，此外，陳縣長身為行政首長應當扛起責任，當執行單位在清運過程遇上困難，陳縣長就該出面排解阻礙，好比趁李應元6月9日再次來澎湖鎖港紫微宮參加「無塑海洋」活動時，再次向中央請求協助，呼籲中央主持跨縣市協調，幫助澎湖處理垃圾。但陳縣長態度消極，讓澎湖成為中央不疼、地方父母官不愛的孤兒。
賴峰偉表示，在湖西鄉垃圾轉運站垃圾堆置問題爆發後，他第一時間就要求不應再拖2個月，必須專案處理，儘速解決，避免天氣炎熱，爆發傳染病等衛生問題。4個月後，垃圾量愈來愈多，雖然天氣轉涼，依然有公共衛生隱憂，他呼籲中央及地方應該聯手儘快清運，同時務必注意第一線作業清潔人員的健康安全。
至於中長期的垃圾解決之道，他認為，未來澎湖必須落實「垃圾回收」，從源頭減量，鼓勵家戶、機關、業者做好垃圾分類。必要時，可試辦垃圾費隨袋徵收，提高垃圾分類誘因。
賴峰偉表示，最終，澎湖必須「垃圾在地處理」。配合垃圾減量、資源回收、堆肥、機械生物處理、氣化、新式高效能焚化爐等科技，建構自主的垃圾處理能力，根本解決問題。
