由於南方四島屬於方山地形及自然鋪面，大型機具難以進入，清運工作必須依賴人力搬運與船艇接駁。為了突破地形限制並提升清理效率，海管處去（114）年引進獨木舟協力合作結合繩索垂降方式，讓清理人員能深入峭壁與海蝕溝等險峻地形，並將卡在死角的海漂垃圾順暢移出；並今（115）年5月起在陸域全面推動「行動垃圾車」收運機制，從海岸清理到陸域垃圾處理，逐步強化南方四島廢棄物管理。
國家公園署指出，為克服絕壁與海蝕溝等地形限制，海管處串聯民間專業團隊，以不同方式突破清理困境。每年皆由「社團法人臺灣承諾公益協會」號召專業志工團隊於崖頂架設繩索固定系統，讓人員安全地垂降至數十公尺深的海蝕溝進行垃圾打包；去年更特別邀請「台灣獨木舟推廣協會」加入清理行列，以獨木舟編隊穿梭於暗礁密布、狹窄溝渠，依序深入潮間帶與淺礁區，將收集完成的海漂垃圾透過水路運往東吉島集中進行後續清運作業。此海陸並進的作法，有效化解懸崖峭壁下與死角下長年積累的清理難題。
除海岸峭壁與海溝的海漂垃圾清理外，海管處今年5月起全面推動「行動垃圾車」收運機制，使陸域環境維護管理制度邁向新的里程碑。國家公園署表示，過去島上設置定點公共垃圾桶，易遭隨意棄置廢棄物，垃圾受海風吹散或野生動物翻咬，導致環境髒亂，為落實「垃圾不落地」理念，每週一、三、五、日採定時、定線方式巡迴收運生活垃圾與廚餘，截至目前已妥善轉運23噸生活廢棄物。實施新制後，居民只需於自家門口即可直接交付妥善分類的垃圾，提升生活品質的同時，更是從源頭降低廢棄物散落及進入海洋環境的風險。
國家公園署強調，離島環境永續需公私部門與全民參與。呼籲前往南方四島的遊客確實實踐「無痕旅遊（Leave No Trace）」精神，隨手帶離旅程中產生的廢棄物，或於行動垃圾車服務時段妥善交付予清潔人員。海管處未來將持續結合公私協力、落實源頭管理與環境教育，讓南方四島珍貴的海洋環境得以永續傳承。
▲獨木舟收集好垃圾送上接駁小船，再由小船送往東吉島集中處理。
▲志工團隊於崖頂架設繩索固定系統。
▲志工團隊於崖頂架設繩索固定系統。