場館一樓為種苗生產與保種區，設有室內育苗池、大型海藻種區及海洋物種研發區；二樓為參觀展示空間，包含教學展示區、標本櫃、水族展示區及海洋劇場。民眾可透過觀景窗了解育苗作業流程，並參與專人導覽、藻卡製作及珊瑚植栽等體驗活動，以實作方式認識海洋復育原理與生態價值。
三樓戶外觀景平台可遠眺虎井嶼、桶盤嶼與望安島，結合自然景觀與教育功能，提供兼具學習與休憩的空間。目前規劃「魚源解碼戰」、「珊瑚觀察家」、「種源方程室」、「觸海生情」及「藻安你好」等五套主題課程，歡迎機關、學校及團體預約參訪，申請環境教育時數。
水產種苗繁殖場提供各機關、團體、各級學校及一般民眾免費參觀，並受理海洋環境教育課程預約。相關開放及預約資訊，請至澎湖縣水產種苗繁殖場官方網站或臉書粉絲專頁查詢；如需預約導覽，亦可於開館期間來電洽詢（電話：06-9951065）。
誠摯邀請社會大眾蒞臨參觀，透過實地體驗與學習，深化對海洋環境的認識與關懷，共同維護澎湖珍貴的海洋資源。
▲打造具地方特色的海洋保育教育中心水產種苗繁殖場，邀你一起來參觀。