由於海星所過之處猶如海底森林大火，健康的石珊瑚會被啃光，影響珊瑚魚及其他生物棲息，造成生態浩劫。
海保署表示，針對棘冠海星族群密度異常升高之情形，以即時監測與科學管理原則，發現異常即啟動調查與必要之移除作業，以維護珊瑚礁生態系之健康。（通報網址: https://iocean.oca.gov.tw/；line: https://lin.ee/bMpkAt5）。
針對七美通報，6月2日及6月7日分別進行2次穿越線調查，涵蓋共8條樣線，調查面積合計4000平方公尺，共發現47隻棘冠海星，換算每公頃密度達警戒值，預定6月18日起展開第一波移除作業。
管碧玲表示，海保署已成立專責機構負責，另外台灣海龜救護，已在小琉球設立友善路燈，同時太平島海龜登岸產卵，成為世界海龜研究重鎮，7月1日希望海保法能正式通過。
署長陸曉筠則表示，七美棘冠海星已建立通報機制，一經通民眾報，就採取即見即清政策，並密切觀察未來發展趨勢。
目前海保署規劃清除棘冠海星的作法，原則上，超過一定密度的區域以專案委託團體進行清除。其餘地區則規劃鼓勵民眾、潛水相關人員參與，訂立獎勵金，相關執行細節，海保署將儘速邀請相關單位研議後，研訂執行規範並公告周知。
▲七美海域棘冠海星大爆發，海保署6月18日起展開移除作業。（澎湖海洋保護志工團隊提供）