車船處表示，實施本項航班，主要係照顧離島居民、便利望安、七美二鄉離島居民交通往返及公務洽公之便，並有助於推展鼓勵一般民眾南海觀光旅遊夜宿觀星吃海鮮，提昇南海旅遊觀光事業、登島旅客人數以提昇搭乘率。
本項增開夜泊七美航班必須依照使用者付費原則收費，但為兼顧離島居民福利，車船處給予設籍望安、七美居民搭乘馬公-望安或馬公-七美票價統一為201元的優惠，一般乘客則仍依車船處公告票價表收費。
為方便乘客事先規劃行程，夜泊七美航班歡迎於澎湖交通船購票系統(https://auth.penghu-go.tw/ticketinfo)線上預約，受理對象為一般民眾，每航次名額為50名（額滿為止，不再增開加班船）。如因旅客個人因素致取消行程者，得於開航前1日21:00前線上退票，手續費為船票票價10％，現場購票者請於該航班開航前1小時至乘船現場購票。
基於安全性考量若因風浪過大或如有因颱風或天氣等不可抗力因素致航班停駛者，本處將不另行通知，請自行上本處網站(http://www.phpto.gov.tw)查看，有關航班如有異動將隨時公告於候船室及車船處網站最新消息，倘造成民眾之不便，敬請見諒。