車船處表示，實施本項航班，主要係照顧離島居民、便利望安、七美二鄉離島居民交通往返及公務洽公之便，並有助於推展鼓勵一般民眾南海觀光旅遊夜宿觀星吃海鮮，提昇南海旅遊觀光事業、登島旅客人數以提昇搭乘率。
同時為了讓乘客有充足時間停留在七美，暢遊在地風光，有更多航班選擇，去程可搭乘每日固定航班09：30開航、每週一、二夜泊七美16：50開航、每週五之週五專船16：50開航或7/5、7/12、7/15延航高雄航班08：00開航；返程每日固定航班13：30開航、每週二、三夜泊七美06：10開航、每週五之週五專船18：20開航或7/6、7/13、7/16延航高雄航班15：30開航。
本項增開夜泊七美航班必須依照使用者付費原則收費，但為兼顧離島居民福利，車船處給予設籍望安、七美居民搭乘馬公-望安或馬公-七美票價統一為201元的優惠，一般乘客則仍依車船處公告票價表收費。
為方便乘客事先規劃行程，夜泊七美航班將自開船日前1個月受理電話預約訂票，受理對象為一般民眾，每航次名額為60名（額滿為止，不再增開加班船），訂票時間為每日11:00~19:00。訂票專線(06)9272376完成電話預約訂票者，乘客可於開航前一天或當天在總站開票，並可購買(開)來回票；開航當天在侯船室現場可購買來回票。如因旅客個人因素致取消行程者，得於開航前1日21:00以前來電06-9272376申請退票，手續費為船票票價10％。現場購票者請於該航班開航前1小時至乘船現場購票。
基於安全性考量若因風浪過大或如有因颱風或天氣等不可抗力因素致航班停駛者，本處將不另行通知，請完成電話預約訂票者，自行上該處網站(http://www.phpto.gov.tw)查看，有關航班如有異動將隨時公告於候船室及車船處網站最新消息。