南投高中設有普通科，高職部有建築科、美工科、電腦機械製圖科、電子商務科、電子科、電機科、應用英語科。另設音樂班，體育班（設有拔河隊、柔道隊以及網球隊。其中拔河隊，曾於2016年荷蘭世界盃拔河錦標賽青少年560公斤組奪得冠軍）。教室、宿舍、餐廳及晚自習教室裝設空調。教室另裝設視訊設備。制定國中生獎賞制度「清寒、優秀新生入學獎勵辦法」。成立宗旨是聯繫校友感情，砥礪學術研究，促進校友事業合作，協助政府推行政令，並協助母校之發展為宗旨。
南投高中與馬公高中性質雷同，除了有音樂班、體育班之外，也有許多專業群科，包括建築科、美工科、電腦機械製圖科、電子商務科、電子科、電機科、應用英語科等相當多元豐富。師生千餘人，學校規模與馬公高中相仿。
馬公高中石仲哲校長表示，受群山滋養的南投高中與被海洋養育的馬公高中交流，碰撞出許多的火花、相互激勵與學習，互動氣氛佳、交流圓滿、相約下次南投再敘。
△馬公高中石仲哲校長（右一）與南投高中傅國樑校長（右二）互動氣氛佳、交流圓滿。（嚴光澎攝）
△馬公高中石仲哲校長與南投高中傅國樑校長、主管同仁、老師一行人蒞馬公高中交流參訪。（嚴光澎攝）
△馬公高中石仲哲校長與南投高中傅國樑校長、主管同仁、老師一行人蒞馬公高中交流參訪。（嚴光澎攝）