據了解，航港局及港務公司為馬公港務大樓周圍施工及因應遊客安全與落實通關安檢，自5月13日起規劃 13 :00 至17 :00 採旅客與車輛分流。
港務公司在港埠大樓東西側臨海路段進行管制，設置行人徒步區，供旅客排隊通關。結果，旅客還是被「管制」在大樓冷氣間外的街道，久久進不了港埠大樓。
有導遊表示，下午這時候通關團體幾乎都會同時來報到，要進候船室就一定會報到排隊的狀況，這麼多年來一直都如此，期待新的候船室蓋好，改善這樣的狀況。
尤其，遇到每週看完花火結束要返台都會有這樣的情形。導遊說，這個是很正常的情況，一艘船的基本400人，兩艘船就會達到1000人，1000人要容納在這樣的空間內，最主要船的載客量大，不像飛機僅七、八十人，這是沒辦法的事。
導遊表示，花火節期間每個星期二、六比較會有這種情況，其他時間還好。最主要澎湖的旅遊型態，大部份的旅客都在3點半後才離開澎湖，配合七美、望安回來的時間，變成澎湖一個奇特的狀況。
航港局公告「航季期間馬公港埠大樓前，臨海路於旅客通關期間(13:00-17:00)實施道路封閉管制，並作為行人徒步區，前方石源廣場僅提供大型遊覽車、中型巴士車輛進入臨停下客(登船旅客)，小型車輛請改道至消防隊前臨停下客。」
△觀光客大排長龍等候通關坐船。（莊惠惠攝）