教育處指出，本年度校長遴選由各申請遴選校長以簡報方式分享辦學理念，提供遴選委員評選之參考。委員經綜合評比各位校長辦學績效考評、治校理念及遴選志願等，採無記名投票方式提供縣長遴聘建議。本次計有國中7位現職校長及國小9位現職校長，共16位校長提出遴選申請。為利中正國中籌備轉型為實驗學校，因此暫派胡正孝校長為中正國中校長1年。
本縣113學年度國中小校長遴選核定名單如下：
國中部分：文光國中：葉天文、中正國中：胡正孝（暫派1年）、澎南國中：鄭維傑、湖西國中：藍淞地、白沙國中：陳冠全、鳥嶼國中：仰瓊宜、將澳國中：夏德清。
國小部分：石泉國小：馬長生、風櫃國小：林妍伶、講美國小：張宏宇、鳥嶼國小：王雅嫺、池東國小：鄭源順、內垵國小：陳穎榛、外垵國小：莊文啟、雙湖國小：謝宗融。
澎湖縣長陳光復表示，本縣國中小多屬小型學校，學校運作環環相扣，任何環節都不能疏漏。校長是學校的總舵手，統籌學校事務、連結各處室業務，並領導校務發展，校長的智慧與溝通能力需與時俱進，才能夠不斷提升教學效能。期許連任校長能夠延續前一任期之未竟任務，如學校工程、教學設備採購，持續健全校務發展，也期勉調任校長勇於任事，整合社區資源，擘畫出學校發展願景，並秉持著服務奉獻的精神，全心全力投入校務，為本縣的教育工作挹注新的活力，營造出適於孩子們學習成長的校園。