非應屆畢業生一律個別報名，非應屆畢業生請於3月4日上午8時至3月6日下午5時至教育會考試務網站https://cap.rcpet.edu.tw完成網路報名，並於3月7日至3月9日上午8時至12時，下午1時30分至5時親自國立馬公高中教務處報名及繳費，報名費為新台幣500元，低收入戶子女或其直系血親尊親屬支領失業給付者，檢附低收入戶證明及戶口名簿影本或公立就業服務機構核發之「就業保險失業（再）認定、失業給付申請書及給付收據」正本及戶口名簿影本，報名費則予以全免優待；中低收入戶子女檢附中低收入戶證明及戶口名簿影本，報名費減免60%（報名費新台幣200元）。
集體報名考生請洽就讀國中之報名單位；個別報名考生報名方式及應繳資料請參閱澎湖考區簡章，簡章可至澎湖考區資訊網站：https://www.mksh.phc.edu.tw/澎湖考區國中教育會考下載。考生及家長如需了解國中教育會考相關訊息，可至國中教育會考網站查詢，網址https://cap.rcpet.edu.tw。