本縣水源可分為湖庫水、海淡水與地下水三種類型。過去由湖庫水與地下水支應，但澎湖天氣熱、水源容易蒸發，如果缺降雨、颱風等，蓄水率就會偏低，地下水則因擔心地層下陷而減量使用。
本縣雖於2000年成立海水淡化廠；2019年竣工海水淡化二廠，但由於海水淡化技術、設備與建廠的營運成本都相對高。如：一度水售水成本約三十元至一百元，與本島平均十元相較，價差三至十倍。本縣民眾用水量雖低於全國平均，但是缺水問題，依然是我們需要積極面對並做出氣候變遷異常的因應作為。
環保局表示，生活用水在總用水量中約占比19%，珍惜水資源不僅是保護環境的做法，更可節省日常生活中的開銷。因此建議民眾可從家庭用水的三大源頭：廚房、浴廁、洗衣做起，可使用的方法包括：(一)回收洗米洗菜水，作為盆栽花木澆灌使用；(二)使用用過的餐巾紙等吸取油脂，減少清水使用；(三)洗衣時使用具環保標章之洗劑及肥皂，並選擇省水洗劑或洗衣機。此外，在洗澡時以淋浴代替盆浴，並不超過15分鐘、使用可控制水量之蓮蓬頭，或將傳統馬桶加裝二段式沖水配件等，這些都是能夠降低污染產生與節省水量與荷包的好方法。
