縣府受理鄉親機位需求，以澎湖籍鄉親優先，經彙整統計需求後，協調航空公司增開包機因應，也請民航局協調航空公司自主加開加班機，並請立榮航空公增開6月22日、25臺北航線、6月22日、24日臺中航線各1班包機，並已於6日完成第2次通知開票作業，預計未開票之機位將於7日上午12時起開放，有機位需求民眾請逕洽立榮航空銷售通路訂位購票，另於今6日再協調華信增開6月22日臺北航線及6月22日及25日高雄航線各1班包機，並將於8日起通知開票。
旅遊處表示，若民眾未於期間接獲通知可上網查詢http://booking.penghu.gov.tw/，或若期間仍有機位需求請洽專線：0800880180；06-9276675及1999專線，也希望鄉親能加入縣府LINE官方帳號及澎湖縣政府旅遊處臉書，以利提供相關交通資訊。
另，受限部分飛機如A321、 738機型因下貨艙無空調溫控設備，除水產類其他活生動物恕不受理託運，民眾如有託運寵物需求，請先電洽航空公司確認。