澎湖國家風景區秘境景點眾多如：受潮汐影響望安天台山海賊洞、北寮奎壁山後方沙灘及後寮天堂路等，多處皆為遊客不易到達並有許多潛在危險之地，且無管理人員及人煙稀少，倘發生意外其救援難度相對較高，如遊客欲前往務必結伴同行，並瞭解自己健康狀況，隨身攜帶必備藥物，隨時注意新聞、電視、廣播有關潮汐狀況及氣象報導掌握情況，注意自身旅遊安全，玄武岩區注意落石、懸崖岸壁注意跌落，無救生人員管理之海邊，請勿游泳、戲水。
交通部觀光局澎湖國家風景區管理處，每年3月的第3週辦理「旅遊安全宣導週」相關宣導活動，主要目的在提醒遊客注意旅遊安全重要性，期望大家都能「開心遊，平安歸」。澎管處針對旅遊安全五大面向宣導：飲食安全、住宿安全、遊樂安全、自救防護與消費者權益等。詳細內容詳見澎管處觀光資訊網/業務資訊/旅遊安全宣導資訊專區內容。
