澎湖縣政府稅務局表示，不少廠商認為電子契約為無實體契約書，便誤以為不必繳納印花稅。但依財政部頒布之釋令規定，以電子簽章方式簽訂之電子契約，與紙本書面同屬正式文件，於法律上具有相同法效果。因此，政府機關依政府採購法規定，與得標廠商採電子簽章方式簽訂之政府採購電子契約，係屬在我國境內所書立之課稅憑證，應依印花稅法規定徵免印花稅。
稅務局進一步說明，為維護租稅公平，遏止逃漏稅捐，每年均進行印花稅檢查，廠商如有簽訂電子契約，請自行檢視應否繳納印花稅，並依稅捐稽徵法第48條之1規定自動補報補繳所漏稅款及加計利息，以免受罰，稅務局特別提醒，如電子契約採大額繳款書或彙總繳納者，檢查時請提供電子檔案供查核即可，無須列印紙本契約。
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