人潮帶來錢潮，負擔沈重的大量垃圾也隨之侵襲。離島並未建置焚化驢，因此無法消耗大量垃圾廢棄物，在後端處理上需耗費更多時間與金錢。遊客來澎湖縣內旅遊，多使用一次性塑料廢棄物，如寶特瓶、飲料瓶等，因此本局呼籲遊客可自備環保容器，利用縣內飲水機裝用飲水，降低塑料廢棄物使用，亦能使用Rent go環保杯租賃共享服務，透過簡單租還方式，提升環保杯使用意願，同時大幅改善垃圾源頭產生。
環保局表示，自民國94年起推動垃圾強制分類計畫，垃圾區分為「資源」、「廚餘」與「一般垃圾」等三類，以利後端回收處理。因而，大眾更需留意垃圾分類，這不只能減少垃圾量將資源再利用，落實分類也能拉長焚化爐、掩埋場使用年限，無形中也減輕餐飲等店家後續處理，令店面場域整潔。
此外，除前述建議大眾使用環保容器外，環保局呼籲將自己攜帶的垃圾帶走，不隨處亂丟，享受澎湖美麗風光時，也須盡一份心力讓環境永續留存。