為提供民眾海洋環境教育場域，澎湖南方四島國家公園東吉嶼與嶼坪遊客服務中心依容留數40人、嶼坪遊客休息室20人進行人流管制。但為加強離島地區疫情管控，申請進入特別景觀區進行海陸域環境教育活動與水域體驗活動，活動人數維持20人以下之管制。海域遊憩區除無法全程配戴口罩的水域活動原則不開放外，其它在非群聚、單人活動、能保持社交安全距離及活動前後配戴口罩的條件下，可進行水肺潛水、立槳(SUP)及獨木舟活動，但立槳及獨木舟僅可1人操舟，不開放2人以上共乘，並將視現場狀況及遊客是否遵守防疫規定，隨時進行動態調整。
澎湖南方四島國家公園屬離島地區，請民眾來園區時，務必遵守各項防疫規範，包括全程戴口罩、不群聚、保持安全社交距離，也呼籲民眾及相關業者應自行考量能否符合防疫規定，再從事各項相關活動，如澎湖縣政府另有其它更嚴格的防疫管制或封閉措施，海管處將配合辦理，請民眾持續配合防疫措施，守護彼此健康。
△海洋國家公園管理處二級警戒管制措施。
