行政院推動「向海致敬-海岸清潔維護計畫」海洋政策，建立海岸清潔完整管理制度，達每寸土地皆有管理機關、每寸海岸都能保持乾淨的目標，海管處除定期清理遊客經常造訪之熱點海岸，並委託廠商清理堆積多年的海漂廢棄物，及不定期舉辦淨灘相關環境教育活動，以維護海洋環境清潔。
由於澎湖南方四島國家公園園區內多數海岸以玄武岩、咾咕石及礫石灘為主，陡峭的地形搭配季風、海浪等自然因素使海漂廢棄物長期滯留且難以清運；為不讓園區內那壯闊的玄武岩及美麗的岸際潮間帶埋沒於垃圾堆中，海管處透過人力撿拾及海上接力清運方式來進行海岸清理。
除東西嶼坪外，西吉嶼則自 7 月 14 日起則以每日 8-10 人次進行海岸清理作業，考量颱風影響及後續東北季風限制，將陸續增加清理人力，同時進行多處海岸清理工作，預計於10月前完成東、西吉嶼共計8萬平方公尺之海岸清理，清理之海漂廢棄物將利用船舶運至合法垃圾處理場進行後端處理作業，期待透過今年全面性的海岸清理作業，還給四島一個清淨的新面貌。