馬公高中日前109學年度第2學期期末校務會議通過（修正版）校訓；計畫目標加強本土海洋文化深耕，配合108課程綱要，規劃特色課程，涵養愛鄉愛土的胸懷；發展科學及自造者教育，培育優秀的科學創新人才；發展第三語系教育，並持續推動日系國際教育交流活動，深耕雙語教育；汰舊更新各項教學設備、因應108學年課程綱要設備要求等等。
教育目標，秉承傳統，接軌現代，開創未來，凝聚親師生共識，建立學校願景，以「海洋立校、多元展能、公民實踐」為培養新世代學子之願景，「誠正勤毅」為校訓，學生為主體，營造「溫馨校園、全人教育、終身學習」為目標，希冀能夠營造優質學校文化，學生能健康快樂、活力學習，培育馬公高中學生具有「立足澎湖、胸懷台灣、放眼天下、行腳世界」之器度與勇氣，兼具「誠信、正義、勤儉、堅毅」之特質，成為一個優質的世界公民。
△國立馬公高中110-117學年度中長期校務發展計畫。（嚴光澎翻攝）