依據國外研究，打AZ疫苗出現血栓的風險概率約為10萬分之1.23，中央疫情指揮中心也公布血小板減少或任何凝血功能異常、免疫功能不全者、懷孕或是可能懷孕的女性，應謹慎評估施打疫苗的風險。
澎湖縣政府表示，施打疫苗有潛在風險，當過於追求疫苗施打速度時，無形中會給予醫護人員壓力，醫師無法詳細評估施打者健康狀況是否適合打疫苗，反而增加風險性，尤其高齡者慢性病多、生理機能較弱，更應謹慎。
澎湖縣政府指出，國內部分縣市啟用大型體育場接種站，宣稱不用預約，可現場立即施打，卻發生電腦健保卡系統當機、人潮排隊塞車、無法保持社交距離、長者戶外排隊中暑等情況，反而造成民眾不便。
澎湖縣政府表示，縣府衛生局長年執行流感疫苗施打，熟悉離島特性，在兼顧效率及安全的原則下，採取預約、分流策施，賴峰偉更要求針對長者必須「求好不求快」，每位長者必須經由醫師詳細詢問疾病史、用藥過敏史及評估身體狀況後才可接種。
澎湖衛生局評估每個疫苗接種站空間、人力配置，通知適合的人數分批施打，長者不必在大熱天下排隊等候，且有專人引導動線、協助登錄資料，施打後也有舒適空間可以留觀30分鐘以上，因此施打秩序良好，沒有出現外縣市的狀況。
澎湖縣政府表示，澎湖的人口結構、地理狀況，不適合台灣大都會的大型接種站，以「小而美」配合預約的施打模式最適合澎湖，即使新北市也採分區、分里、分時段、分流接種，類似澎湖的作法為長者施打疫苗。
△澎湖疫苗接種以預約、分流方式，經醫師詳細問診，評估健康許可後才施打。