三總澎湖分院擔任地區唯一法定傳染病收治機構，也是中央疫情指揮中心授權澎湖唯一提供疫苗接種醫療機構，自3月22日由施宇隆院長率先先打後，依照指揮中心政策，陸續開放出國或特殊需求的民眾自費施打，迄今共計完成超過250人次施打，未傳出有嚴重不良反應案例。
為提高全國施打率增進國人免疫成效，疫情指揮中心循序漸進，宣布同時開放第7梯次（軍人）及第8梯次（65歲以上民眾）施打，65歲以上鄉親可自下週17日起，至三總澎湖分院家庭醫學科或感染科掛號預約接受施打。
本次澎湖地區三軍部隊，首批約近6百名官士兵登記自願接受施打Astra Zeneca COVID-19疫苗，醫院預計以10日的時間施打完畢，後續再依登記人數調整施打場次。開始施打第一日，即由海軍馬公後勤支援指揮部吳啟興指揮官拔得頭籌，帶領海軍官士兵完成接種，同時增進官兵對疫苗施打的信心。
施宇隆院長表示，COVID-19疫苗採購不易，且每位施打者都必須經過專業醫師評估後才能接受施打，施打後安排在場休息，以追蹤是否有不良反應。衛生福利部為掌握施打者的健康，可在現場掃瞄QR碼，提供施打者利用LINE app下載「Taiwan V-Watch」疾管家健康回報系統，方便讓接種者可隨時回報健康狀況，也會提醒接種者第二劑疫苗施打日期，疫苗安全性及施打流程請大家放心。
△統一說明施打流程。
△馬支部指揮官吳上校接受醫師評估。