馬公漁港環境維護平時由農漁局及安心上工人員定期巡護清理，亦配合天候風向駕駛漁港巡護筏穿梭馬公漁港水域清理海漂垃圾，並會同澎湖區漁會整理漁具倉庫、碼頭及進行漁港環境消毒，讓漁港環境整齊美觀。
透過本次評鑑給予我們維護漁港的肯定及鼓勵，也藉由本次二星級的評價經過評鑑委員及民眾的認證，也請鄉親以及來自各地的澎友們，共同攜手維護縣轄漁港環境整潔，減少使用瓶裝水，落實垃圾不落海，不隨意丟棄於港區，發揮你我公德心，讓我們共同擁有賞心悅目的漁港魅力，走向親近海洋提升漁港環境品質。
△馬公漁港獲頒109年度金鑑漁港二星級評價。