依據衛生福利部疾病管制署截至本（109）年10月31日統計資料顯示，本國籍愛滋感染者人數累計40,835人，其中今年新增1,190人，較去年同期(1,507人)降幅21%。感染危險因子以不安全性行為主。
愛滋感染風險主要包括不安全性行為及共用針具，其中不安全性行為最有效預防的方式為全程正確使用保險套；另為加強篩檢以期早期發現早期治療，本縣提供多元篩檢管道，各鄉市衛生所以及部立澎湖醫院都有提供愛滋病匿名篩檢服務，提供免費檢查。另外，各鄉市衛生所亦有「在家愛滋自我篩檢試劑」可購買，本年度於本縣港務大樓一樓入口處有新裝設1部「愛滋自我篩檢試劑」販賣機，提供民眾多元的篩檢管道。而感染愛滋病毒者，只要早期發現接受治療，規律用藥治療至病毒量檢測不到，既可大幅降低傳染他人的風險，亦可有效控制病情，生活品質與正常人無異。
本縣配合中央政策，持續推動預防、篩檢及治療等各項愛滋防治工作。衛生局局長蕭靜蓉呼籲，愛滋傳染不會區分性別、性向，社會大眾應以尊重、接納的態度，認知預防及早期診斷早期治療的重要性，以共創愛滋3零。有關愛滋病防治相關資訊可至疾管署全球資訊網（http://www.cdc.gov.tw）或撥打國內免付費1922防疫專線洽詢。