馬公第三漁港不僅連結虎井、桶盤、七美及望安等離島的南海交通航線，更是本縣交通觀光的重要樞紐，每年往返上述南海離島的客運流量更是可觀。重光漁港及後寮漁港則分別是連接大倉漁港及北海離島的重要港口，為維持交通船碼頭設施機能，縣府每年不遺餘力編列經費維護。
縣府工務處表示，近來本縣觀光蓬勃發展，交通運輸為本縣觀光命脈之一，爰此，縣府每年向交通部申請經費，逐步改善本縣交通船碼頭設施，以符合交通船泊靠需求。本工程完工後將保障乘客上下船安全、提升交通船碼頭設施品質。同時感謝交通部重視本縣交通船碼頭設施及每年核定經費補助本府交通建設。