三總分院10日凌晨通報9日晚間澎水職校等學生傳出腹瀉群聚，澎湖縣政府衛生局隨即展開調查，並立即前往台華輪進行稽查，共採集3件環境檢體、6件人體檢體，截至目前為止，共計傳出澎湖台南兩所學校分別30名、11名及1名員工共計42名師生受到感染。
據查學生皆為實習學生，實習期間工作實習地點及住宿皆於台灣本島某飯店，除了共同提供的餐飲感染外，衛生局不排除諾羅群聚，立即通知相關縣市的衛生局加強住宿及交通的清潔工作以避免疫情擴大。
依據調查顯示澎湖金門台南三所學校共計131名師生，澎湖分為兩梯次四個班級共計86位師生，42名有症狀的個案，其中澎湖海事學校佔30人，住宿於台灣本島某飯店，9月6日出發前往台灣本島實習9月8日返回澎湖，9月9日晚上8點多續有學生因腹瀉、嘔吐、發燒等症狀前往三軍總醫院澎湖醫院及部立澎湖醫院就醫，衛生局疫調時發現台灣本島亦有5名個案就醫外，9月8日曾共同食用便當，發病者大多住3樓及6樓的樓層，房間分佈有集中趨勢，不排除諾羅群聚的可能。
校方初步調查，部分學生指出在台華輪船上食用的中餐便當可能有問題，當下就覺得豆干的味道怪怪的。
校方表示，部分班級暫時停課兩天因應，醫院也指出，病患陸續出院回家休養觀察，目前研判應是集體染患諾羅病毒，真正肇事原因仍待化驗結果釐清。
衛生局表示，諾羅病毒具多種型別，任何年齡層都可能經由吃到被污染的食物或飲水、手部接觸受污染的物品再碰觸自己的口鼻或眼睛黏膜、與病人密切接觸或吸入病人嘔吐物及排泄物所產生的飛沫而感染。秋冬是好發諾羅病毒的季節，近期群聚事件檢出病原多以諾羅病毒為主。有疑似症狀(尤其是食品從業人員)，應在家休息，至症狀解除至少48小時後，再恢復上學或工作。