「西嶼彈藥本庫」基本上分為兩個區塊，包括土窟式清涼彈藥庫1座，和洞窟式彈藥庫2座(亦即俗稱的「銅牆鐵壁」)。澎湖縣政府99年11月公告為縣定古蹟，100年1月完成土地撥用，101年12月委託楊仁江建築師完成「澎湖縣縣定古蹟西嶼彈藥本庫及東鼻頭震洋艇格納庫調查研究暨修復規劃設計計畫案」。
歷年來經分年分期申請計畫及執行計有：「西嶼彈藥本庫」為縣定古蹟、土地撥用、「澎湖縣縣定古蹟西嶼彈藥本庫及東鼻頭震洋艇格納庫調查研究暨修復規劃設計計畫案」、「澎湖縣縣定古蹟西嶼彈藥本庫修護及再利用後續工程規劃設計等。
本期辦理「縣定古蹟西嶼彈藥本庫修復及再利用第二期工程」，總經費新臺幣1,700萬元(文化部補助新臺幣935萬元，縣配合款新臺幣765萬元)，工程內容包含：服務中心、參訪動線、景觀及導覽解說、軍管圍界、排水設施等，108年10月21日經奉文化部文化資產局核定，目前已完成勞務及工程採購發包及契約簽訂後，即將開工。
發包總工程費為新臺幣1,410萬元整，監造暨工作報告書仍由楊仁江建築師事務所辦理，工程由澎匠營造有限公司承作，工期210個日曆天。
文化局表示，西嶼彈藥本庫自公告起依文化資產保存法進行土地撥用、調研、修復過程，將近10年的時間，透過古蹟修復及再利用工程，保存西嶼彈藥本庫之完整性，並呈現歷史之脈絡。亦為維護軍事古蹟原始風貌，配合文旅年內完成修復，開放參觀，讓更多民眾與遊客，見證西嶼地區豐富的軍事文化與歷史縱深。